Low Resolution Refinement with ProSMART, COOT and REFMAC5

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Low-resolution refinement tools in REFMAC5

Two aspects of low-resolution macromolecular crystal structure analysis are considered: (i) the use of reference structures and structural units for provision of structural prior information and (ii) map sharpening in the presence of noise and the effects of Fourier series termination. The generation of interatomic distance restraints by ProSMART and their subsequent application in REFMAC5 is d...

متن کامل

REFMAC5 for the refinement of macromolecular crystal structures

This paper describes various components of the macromolecular crystallographic refinement program REFMAC5, which is distributed as part of the CCP4 suite. REFMAC5 utilizes different likelihood functions depending on the diffraction data employed (amplitudes or intensities), the presence of twinning and the availability of SAD/SIRAS experimental diffraction data. To ensure chemical and structura...

متن کامل

Low-resolution structure refinement in electron microscopy.

A real-space structure refinement method, originally developed for macromolecular X-ray crystallography, has been applied to protein structure analysis by electron microscopy (EM). This method simultaneously optimizes the fit of an atomic model to a density map and the stereo-chemical properties of the model by minimizing an energy function. The performance of this method is characterized at di...

متن کامل

‏‎design of an analog ram (aram)chip with 10-bit resolution and low-power for signal processing in 0/5m cmos process‎‏

برای پردازش سیگنال آنالوگ در شبکه های عصبی ، معمولا نیاز به یک واحد حافظه آنالوگ احساس میشود که بدون احتیاج به ‏‎a/d‎‏ و‏‎d/a‎‏ بتواند بطور قابل انعطاف و مطمئن اطلاعات آنالوگ را در خود ذخیره کند. این واحد حافظه باید دارای دقت کافی ، سرعت بالا ، توان تلفاتی کم و سایز کوچک باشد و همچنین اطلاعات را برای زمان کافی در خود نگهدارد. برای پیاده سازی سیستمی که همه این قابلیتها را در خود داشته باشد، کوشش...

15 صفحه اول

Handling ligands with Coot

Coot is a molecular-graphics application primarily aimed to assist in model building and validation of biological macromolecules. Recently, tools have been added to work with small molecules. The newly incorporated tools for the manipulation and validation of ligands include interaction with PRODRG, subgraph isomorphism-based tools, representation of ligand chemistry, ligand fitting and analysi...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances

سال: 2014

ISSN: 2053-2733

DOI: 10.1107/s205327331409651x